Área de Estudio
Los hongos y su potencial en la biotecnología: en áreas como la biorremediación, los biocombustibles y el uso de sistemas de expresión heteróloga para la obtención de enzimas de interés industrial, la promoción del crecimiento vegetal y el control biológico por hongos.
Ámbito de trabajo
Los intereses de nuestro laboratorio tienen en común, el aislamiento de hongos (principalmente) con interés biotecnológico, en particular aquellos que permiten mejorar los procesos de biorremediación y los involucrados en la degradación de celulosa para su uso posterior en la producción de etanol como fuente energética alternativa al uso del petróleo y de otros usos industriales. Además es de relevancia la prospección y producción de enzimas fungicas a través del uso de sistemas de expresión heteróloga sencillos que permitan su obtención de manera eficiente. Con esta línea de investigación, pretendemos generar cepas de diferentes levaduras (Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris, Kluyveromyces lactis, etc.) que tengan la capacidad de llevar a cabo la expresión de las enzimas de interés, como esterasas, lacasas, peroxidasas,etc.
Por otro lado, el uso de metodologías “ómica” (es el estudio del conjunto de genomas de microorganismos contenidos en una muestra de un nicho ecológico determinado, su transcripción y su proteoma), permite superar la limitación de no poder cultivar a la mayoría de organismos fungicos de ambientes extremos como los desiertos, glaciares, y zonas contaminadas con xenobióticos. Esto permite caracterizar su potencial metabólico con la posibilidad de expresar aquellos genes de interés para distintas industrias. Recientemente es de nuestro interés la generación de biosensores fúngicos para detectar condiciones ambientales que generan estrés celular.
Por último, hemos aislado hongos y bacterias capaces de promover el crecimiento vegetal y/o de generar resistencia a estrés abiótico como la sequía o condiciones de bajas temperaturas, así como resistencia a patógenos de plantas cuyos mecanismos por el que logran generar esta resistencia deben ser analizados.
Líneas de generación del conocimiento
- Biorremediación de ambientes contaminados y tratamiento de residuos
Integrantes del laboratorio
Dr. Jorge Luis Folch Mallol
Profesor-Investigador(Responsable)
jordi@uaem.mx
Dra. Ma. del Rayo Sánchez Carbente
Profesor-Investigador
Proyectos
- Producción de etanol a partir de residuos lignocelulósicos. Financiamiento CONACyT Ciencia Básica 48256 Z.
- Desarrollo de biosensores fluorescentes codificados genéticamente para estudiar la regulación ambiental de la biología celular. Finaciamiento Conacyt Ciencia de Frontera No. 252952
- Caracterización biofísica de las hidrofobinas de hongos halófilos y su implicación en los mecanismos de resistencia a salinidad. Financiamiento CONACyT Ciencia de Frontera No. 263954
- Bioremediación de suelos y aguas contaminadas.
- Sistemas de producción heteróloga de proteínas.
- Biodiversidad y bioprospección de organismos fúngicos en ambientes extremos
- Caracterización de microorganismos promotores del crecimiento vegetal
Publicaciones
- Valderrama Brenda, Paredes-Valdez Guadalupe, Rodríguez Rocío, Romero-Guido Cynthia, Martínez Fernando, Martínez-Romero Julio, Guerrero-Galván Saúl, Mendoza-Herrera Alberto and Jorge Luis Folch-Mallol. (2016). Assessment of non-cultured aquatic fungal diversity from different habitats in Mexico. Revista Mexicana de Biodiversidad. 87., 18-28 ISSN:1870-3453.
- Ramón Alberto Batista-García, Rocío Casasanero, Alberto Alvárez-Castillo Stephen A. Jackson, Alan D. W. Dobson and Jorge Luis Folch-Mallol. (2016). Prokaryotic diversity from the culture-independent taxonomic analysis of a sugarcane bagasse metagenome. Merit Research Journal of Microbiology and Biological Sciences Vol. 4(1) pp. 022- 038. ISSN:2408-7076
- Edgar Balcázar-López, Luz Helena Méndez-Lorenzo, Ramón Alberto Batista-García, Ulises Esquivel-Naranjo, Marcela Ayala, Vaidyanathan Vinoth Kumar, Olivier Savary, Hubert Cabana, Alfredo Herrera-Estrella and Jorge Luis Folch-Mallol. Xenobiotic compounds degradation y heterologous expression of a Trametes sanguineus laccase in Trichoderma atroviride. (2016). PLoS ONE 11(2): e0147997. doi:10.1371/journal.pone.0147997 ISSN 1932-6203
- Batista-García Ramón Alberto, Sánchez-Carbente María del Rayo, Talia Paola, Jackson Stephen A, O`Leary Niall D., Dobson Alan D. W. and Folch-Mallol Jorge Luis. (2016). From lignocellulosic metagenomes to lignocellulolytic genes: trends, challenges and future prospects. Biofuels, Bioproducts & Biorefining, 10 (6), pp 864-882. ISSN: 1932-1031
- Sánchez-Carbente María del Rayo, Batista-García Ramón Alberto, Sánchez-Reyes Ayixón, Escudero-Garcia Angela, Morales-Herrera Catalina, Cuervo-Soto Laura Inés, French-Pacheco Leidys, Fernández-Silva Arline, Amero Carlos, Castillo Edmundo and Jorge Luis Folch-Mallol. (2017). The First description of a Hormone-Sensitive Lipase from a Basidiomycete: Structural Insights and Biochemical Characterization Revealed Bjerkandera adusta BaEstB as a Novel Esterase. Microbiology Open. 00:e00463. https://doi.org/10.1002/mbo3.463. ISSN: 2045-8827
- Batista-García Ramón Alberto, Kumar Vaidyanathan Vinoth, Ariste Arielle, Tovar-Herrera Omar Eduardo, Savary Olivier, Peidro-Guzmán Heidy, González-Abradelo Deborah, Jackson Stephen A., Dobson Alan D.W., Sánchez-Carbente María del Rayo, Jorge Luis Folch-Mallol, Leduc Roland, Cabana Hubert. (2017). Simple screening protocol for identification of potential mycoremediation tools for the elimination of polycyclic aromatic hydrocarbons and phenols from industrial effluents. Journal of Environmental Management. 198 pp. 1-11. http://dx.doi.org/10.1016/j.jenvman.2017.05.010 ISSN: 0301-4797.
- Fernández-López Maikel Gilberto, Popoca-Ursino Carolina, Sánchez-Salinas Enrique, Raunel Tinoco-Valencia, Jorge Luis Folch-Mallol and Ma. Laura Ortiz-Hernández. (2017). “Enhancing methyl parathion degradation by the immobilization of Burkholderia sp. isolated from agricultural soils” Microbiology Open. En prensa. ISSN: 2045-8827
- Avelar M., Olvera C., Aceves-Zamudio D L., Folch J.L. and Ayala M. (2017) Recombinant expression of a laccase from Coriolopsis gallica in Pichia pastoris using a modified α-factor preproleader. Protein Expression and Purification. 136 14-19. DOI: 10.1016/j.pep.2017.06.001 ISSN: 1046-5928
Colaboraciones
- Dra. Verónica Lira Ruan. (CIDC-UAEM)
- Dr. Ramón Alberto Batista-García (CIDC-UAEM)
- Dr. Ayixón Sánchez Reyes, Cátedras Conacyt, IBT-UNAM
- Dr. Edmundo Castillo Rosales, IBT-UNAM
- Dr. Edgar Balcazar López, Universidad de Guadalajara
- Dr. Elisabet Aranda, Universidad de Granada, España
- Dra. Nina Pastor Colón (CIDC-UAEM)
- Dra. Marcela Ayala Aceves. IBT, UNAM
- Dra. Claudia Martínez Anaya, IBT UNAM
- Dr. Alfredo Herrera-Estrella del LANGEBIO, Cinvestav Irapuato
- Dr. Vinoth Kumar SRM University, India
- Dra. Helena Porta Ducoing IBT-UNAM
- Dra. Raquel Cossio Bayugar. INIFAP
- Dr. Daniel Padilla Chacón Colegio de Posgraduados Chapingo
- Dr. Alan Dobson Corck University, Ireland
- Dr. Jeffry Coleman, Auburn University, USA